gmx_Gyrate

本模块依赖GROMACS计算用户所选原子组的回旋半径(Gyration)。

使用本模块前请注意前置处理已经完成!

Input YAML

- gmx_Gyrate:
    calc_group: Protein

非常简单的参数,选个计算组就行了。 如果用户需要其它的参数,例如gmx gyrate -q等,也可以通过gmx_parm参数去添加。

Output

DIP会将gmx gyrate生成的xvg数据文件绘制成图:

gmx_Gyrate

References

如果您使用了DIP的本分析模块,请一定引用GROMACS模拟引擎、DuIvyTools(https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.6339993),以及合理引用本文档(https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.10646113)。