gmx_SASA

此模块依赖GROMACS进行溶剂可及表面积（SASA）的计算。

使用本模块前请注意前置处理已经完成！

Input YAML

- gmx_SASA:
    group: Protein
    gmx_parm:
      tu: ns

group参数设定要计算SASA的原子组。同时也可以通过gmx_parm增加一些想要添加到gmx sasa命令中的参数。

Output

DIP会可视化计算得到的面积随时间的变化：

References

如果您使用了DIP的本分析模块，请一定引用GROMACS模拟引擎、DuIvyTools(https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.6339993)，以及合理引用本文档(https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.10646113)。